Este trabajo tiene como objetivo comprender la importancia y especificidad del emprendimiento autogestionado, respondiendo algunas de las principales controversias de este modelo. Para esto revisamos algunas teorías de carácter sistémico para comprender la evolución cooperativa: la cooperación desde la perspectiva de la teoría de juegos, la teoría de las élites y algunos estudios de la ecología organizacional. Por medio de un método interpretativo y reflexivo sobre esas teorías e investigaciones actuales sobre el tema procuramos comprender el fenómeno organizacional cooperativo y algunas de sus principales tensiones al desarrollarse: la pérdida de democracia y calidad de la cooperatividad entre los miembros y el consecuente proceso de degeneración. Los emprendimientos autogestionados siguen una dinámica evolutiva con fuertes tensiones internas y externas, pudiendo evolucionar de forma contradictoria en relación a los presupuestos iniciales de cooperación y participación. Conocer esos fenómenos es fundamental para la construcción de prácticas de buen gobiernocooperativo, evitando el processo de degeneración.